2010. 2. 4. 10:41
이전에 Blast 설치 포스트에 보면 마지막에 Blast search를 간단하게 설명했었다. 오늘은 그 Blast search중 프로그램을 선택하는 부분이 있는데 그 프로그램이 어떤것들이 있는지 알아보겠다.
Blast의 5가지 프로그램
- blastp : 단백질 – 단백질 비교 / 관련성이 먼 것을 찾기 위해 치환행렬 사용
- blastn : 염기 – 염기 비교 / 관련성이 멀지 않으며 아주 점수가 높은 매치에 사용
- blastx : 염기(번역) – 단백질 비교 / 새로운 DNA 서열 및 EST 분석에 응용
- tblastn : 단백질 – 염기(번역) 비교 / DB중 코딩 부위를 찾는데 유용함
- tblastx : 염기(번역) – 염기(번역) 비교 / EST분석에 유용하나 많은 계산을 요함